Opłatę za wprowadzenie LZO do powietrza określa się na podstawie jednej z poniższych metod, wyznaczając pomiar:
- emisji niezorganizowanej, będącej efektem instalacji nieszczelnej.
-
na podstawie bilansu LZO w instalacji wykorzystującej związki organiczne jako surowce.
- emisji okresowej lub ciągłej (głównie w instalacjach przemysłu chemicznego, produkcja mas bitumicznych, tworzyw sztucznych, depolimeryzacji)
- emisji zużycia preparatów wykorzystywanych do konserwacji i czyszczenia maszyn.
Obwieszczenie Ministra Środowiska w sprawie wysokości stawek opłat za gazy i pyły wprowadzane do środowiska, określa poszczególne kwoty za substancje organiczne należące do grupy LZO oraz osobno grupę związków organicznych. Według wykazu na 2015 rok, nalicza się :
| aldehydy pierścieniowe, aromatyczne i ich pochodne | 1,28 zł/kg |
| aldehydy alifatyczne i ich pochodne | 1,28 zł/kg |
| alkohole alifatyczne i ich pochodne | 1,28 zł/kg |
| alkohole pierścieniowe, aromatyczne i ich pochodne | 1,28 zł/kg |
| aminy i ich pochodne | 1,28 zł/kg |
| kwasy organiczne i ich związki pochodne | 1,28 zł/kg |
| węglowodory alifatyczne i ich pochodne | 0,11 zł/kg |
| węglowodory pierścieniowe, aromatyczne i ich pochodne | 1,44 zł/kg |
| związki organiczne | 6,39 zł/kg |
Z uwagi na stawki poszczególnych związków organicznych i całej grupy, przy ostatecznym bilansie LZO mogą wyjść spore różnice kwotowe. Dlatego też, aby rozliczać się na bazie konkretnych związków jakie się emituje, trzeba dobrze znać ich udział w swoim procesie produkcji.
Sporządzenie wiarygodnych danych w rozbiciu na związki i wykonanie bilansu LZO umożliwia wniesienie opłaty według ogólnej stawki za związki organiczne ale tylko za tę część emisji, wobec której nie można określić rodzajów substancji wchodzących w skład LZO. Pozostałą część LZO można rozliczyć według wykazu Ministra Środowiska.